Ptaki narażone są na śmierć po zetknięciu z samolotami, przy braku pożywienia, złych warunkach atmosferycznych. Ptak, któremu braknie już sił na dalszą drogę, ginie. Znaczna część ptaków wędrownych pada ofiarą myśliwych. Silne wiaty(zamiecie , zawieje),ataki innych ptaków(drapieżnych)linie energetyczne
Głównymi naturalnymi zagrożeniami dla podążających na zimowiska ptaków są ptaki drapieżne, które atakują stada przelatujące nad ich terenami łowieckimi, a także przemieszczające się bieguny magnetyczne (naukowcy odkryli, że ptaki wędrujące na południe utrzymując kierunek dzięki biegunom magnetycznym, co - przy ich przemieszczeniu - grozi zgubieniem drogi i lądowaniem na środku oceanu) . Z kolei spośród zagrożeń sztucznych, stworzonych przez człowieka, największą zmorą ptaków wędrownych są samoloty, których przeloty dziesiątkują klucze dzikich gęsi i inne Bogu ducha winne stworzenia.
