Organy w Katedrze Oliwskiej należą do najcenniejszych w Europie. W momencie powstania w 1788 były to największe organy na starym kontynencie, a prawdopodobnie także na świecie. W czasie ich gry można nie tylko usłyszeć monumentalny, niezwykły dźwięk, ale także oglądać wspaniały spektakl poruszających się figur. Unikatowe organy wykonał Johann Wilhelm Wulff, po święceniach Brat Michał z zakonu cystersów, który poświęcił im całe swoje kapłańskie życie (1763-1788). Instrument składa się z 5100 piszczałek z drewna lipowego, dębowego, jodłowego i z cyny. Organy ozdobione są niezwykłymi rzeźbami w stylu rokokowym. Prospekt posiada 40 figur, z czego aż 29 jest ruchomych. Anioły trzymają w rękach puzony, trąbki, dzwoneczki i za pomocą specjalnego mechanizmu poruszają się w taki sposób, jakby grały na trzymanych instrumentach. Nad Aniołami unosi się Duch Święty, przedstawiony jako gołębica, a na samej górze kręci się pozłacane słońce i wirują gwiazdy. Wspaniałemu koncertowi i widowisku towarzyszy światło przebijające się przez witrażowe Okno Mariackie. Obecnie słynne organy można usłyszeć na Międzynarodowym Festiwalu Muzyki Organowej (lipiec, sierpień), na prezentacjach w ciągu roku i w czasie nabożeństw.
