Zanikanie jezior jest zjawiskiem negatywnym, gdyż zaburza ono prawidłowe funkcjonowanie konkretnego ekosystemu (przyczynia się do wyginania lub migracji danego gatunku). Poza tym zaburza ono prawidłowy obieg wody w danym środowisku. Zanik jeziora zmienia także mikroklimat. Dzieje się tak na skutek akumulacji osadów na dnie jeziora, które z czasem przekształca się w staw, trzęsawisko, a ostatecznie torfowisko. Prócz czynników naturalnych do zaników jezior przyczyniają się też ludzie. Przykłady działalności człowieka, które sprzyjają zanikom jezior to m.in: tworzenie dzikich plaż, zaśmiecanie danego środowiska, likwidacja roślinności znajdującej się w okolicach jeziora czy celowe niszczenie roślinności wodnej.